Nhiễm khuẩn đường hô hấp trên (bao gồm cả nhiễm khuẩn tai mũi họng) như: viêm amidan, viêm xoang hoặc viêm tai giữa;
Nhiễm khuẩn đường hô hấp dưới, như đợt cấp của viêm phế quản mãn tính, viêm phổi thùy hoặc viêm phổi phế quản;
Nhiễm khuẩn đường tiêu hóa: như sốt nhiễm thương hàn;
Nhiễm khuẩn đường sinh dục: như viêm thận-bể thận, lậu hoặc sảy thai nhiễm khuẩn hay nhiễm khuẩn sản khoa. Các nhiễm khuẩn khác như nhiễm khuẩn huyết, viêm nội tâm mạc hoặc viêm màng não do vi khuẩn nhạy cảm đối với các thuốc nên được điều trị bằng cách khởi đầu theo đường tiêm với liều cao và, nếu có thể, nên kết hợp với một kháng sinh khác.
Dự phòng viêm nhiễm nội tâm mạc: Amoxicillin có thể được sử dụng để ngăn ngừa vi khuẩn huyết có thể phát triển dẫn đến viêm nội tâm mạc. .